- 所在单位：生物医学工程学院
- 职称：教授
- 电子邮箱：nickgnlin@sjtu.edu.cn
- 教师拼音名称：linguanning
- 学历：博士研究生毕业
- 性别：男
- 学位：工学博士
- 在职信息：在职
- 毕业院校：美国密苏里大学(University of Missouri)
生物信息学综合实践课：解码生命信息
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- 课程介绍：<p class="MsoNormal">
本课程是一门理论和实践相结合的实践课，旨在通过“干湿”结合的实践以及校企联合的授课模式，让学生掌握生物医学项目的设计、执行、分析、报告以及合作解决实际问题的能力。<span></span>
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<b>课程主要内容包括：</b>1）学习如何采样和实验来生成真实的基因组数据，如<span>DNA</span>提取、建库、上机测序等实验手操技能；<span>2</span>）学习如何对下机的测序数据进行质量评估、变异检测、大数据管理分析挖掘和溯源分析，最终回归生命的系统性和动态特征；<span>3</span>）对基因组数据进行分析和解读：掌握自身<span>DNA</span>变异筛查、基因型与表型关联分析、遗传性解读和溯源分析等数据分析技能；<span>4</span>）学习生命和遗传伦理的重要性；<span>5</span>）最后进行结果团队讨论与总结等。
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<b>教学目的：</b>该课程采用校企合作的方式，根据真实样本，设计并完成一个完整的人类<span>DNA</span>测序项目。采用项目结果导向的方式，通过小组合作，模拟真实的工作场景。通过真实的样本和数据分析，让学生亲身体验人类基因组学实验及数据分析及结论报告产生的全过程。学习如何在科研中遵守生命和遗传的伦理。并与导师们进行沟通和反馈，帮助学生提高生物信息学实验及数据分析的技术水平和职业素养。学会在<span>Linux</span>环境下处理数据，并使用<span>R</span>或<span>Python</span>编程语言分析数据。
- 考试形式：实验报告
- 开课学年：2023-2024
- 开课学期：春学期
- 课程号：(2023-2024-2)-BIO1110-01
- 学分：2.0
- 课程类型：本科生课程
- 是否精品课程：否
- 选课人数：21
- 课时：32.0
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