王卓

研究员

所在单位:Bio-X 研究院(生命科学技术学院)

学科:遗传学(071007)生物学(化学生物学)(071020)

职称:研究员

电子邮箱:zhuowang@sjtu.edu.cn

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组学大数据

发布时间:2024-12-18

课程介绍:<p>    基因组、转录组以及蛋白质组等组学数据正在飞速产生,并且快速地渗透到海洋科学的具体研究当中。组学大数据是以<span>DNA</span>、<span>RNA</span>以及蛋白质等生物序列为研究对象,以数学模型和高性能计算为技术手段,结合分子生物学的实验方法,研究生物序列大数据的获取和分析的课程。最终目的是通过对生物信息从<span>DNA</span>到<span>RNA</span>到蛋白质之间的储存和流动过程的了解,来系统性地理解海洋生态群落的结构与功能随海洋环境变化背后的分子生物学和生物化学机理。<span></span></p><p>    课程包括:<span></span></p><p>    组学数据的产生,测序仪、质谱仪等分析仪器的基本原理;<span></span></p><p>    主要的组学数据库的介绍,如何搜索、获取组学数据;<span></span></p><p>    组学数据的分析处理流程,常用软件和高性能计算平台的使用;<span></span></p><p>    组学数据的基本统计算法模型与分析工具;<span></span></p><p>    组学数据分析在海洋科学研究中的具体应用实例。<span></span></p>通过课程学习使学生获得必要的基因组、转录组和蛋白质组序列数据获取和分析的基本方法和知识,掌握序列分析的核心算法和基本的数学模型,其数学、统计学和分子生物学理论基础,了解最新的基因组、转录组和蛋白质组序列数据获取和分析的方法和系统,以及它们在海洋生物基因资源研究,海洋生态结构和能量转换过程研究、海洋生物多样性研究等各方面的应用。

考试形式:笔试

开课学年:2024-2025

开课学期:春学期

课程号:(2024-2025-2)-MS3603-01

学分:3.0

课程类型:本科生课程

是否精品课程:

课时:48.0

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