郑舰艇

副教授

所在单位:生命科学技术学院

职称:副教授

电子邮箱:jtzheng@sjtu.edu.cn

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应用生物信息学

发布时间:2020-06-12

课程介绍:本课程从分子生物学、计算机技术和统计学等学科交叉视角,学习生物信息学基本方法和应用。介绍在基因组学、转录组学和蛋白质组学等功能组学背景下,生物信息学常用的开放工具和数据库。本课程将丰富以生物学为主要背景学生的知识体系,帮助学生掌握获取和分析NGS数据的基本方法。重点介绍Linux操作系统,分子生物学数据库,分子生物学工具包EMBOSS,序列比对工具BLAST,在线生物信息学分析平台GALAXY及统计学工具包R等常用工具的使用。<br />
此外,以我们课题组自己开发的细菌基因组学分析软件及数据库为例,将用细菌耐药基因水平转移等具体实例展示给学生,如何用生物信息学的方法及研究思路来解决生命科学里的实际问题。以期引发学生对生命科学的研究兴趣,启发学生的独立思考能力。<br />

考试形式:笔试

开课学年:2020-2021

开课学期:秋学期

课程号:(2020-2021-1)-BI437-1

学分:2.0

课程类型:本科生课程

是否精品课程:

选课人数:46

课时:32.0

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